Алиас алиасом, но перебрасывать будет на тот адрес, который прописан в конфиге. Если я не ошибаюсь, то мультидоменности в Жумле нету. В любом случае, я бы начал с проверки правильности прописывания алиаса.
Только заметил....
www.домен.ru.mastertest.ru - Вы именно в таком виде алиас прописываете?
Да и задача не совсем ясна. Если переезд на новый хостинг со старым доменом, то старый домен нужно просто привязать к новому хостингу. Если переезд на новый хостинг с новым доменом, то меняем адрес сайта в конфиге. Если нужно, чтобы со старого домена попадали на новый адрес - прописываем этот домен, как дополнительный.
Да. Именно в таком. Сейчас сайт лежит на другом хостинге. На новом есть возможность проверить работу сайта путем добавления алиаса. Вот я это и делаю. Все конфиги правлю как надо - прописываю везде www.домен.ru.mastertest.ru
Самое интересное, что если обращаться www.домен.ru.mastertest.ru/administrator/index.php - все работает. Если www.домен.ru.mastertest.ru/administrator/ - перебрасывает на www.домен.ru/administrator/