Ну по поводу логики работы можно спорить, поэтому категорично называть ошибкой такое поведение нельзя.
К тому же, многое зависит от настроек редактора.
С JCE я работал мало, по нему не подскажу, но вот в Spaw, с которым работаю, этот вопрос решаемый:
Spaw (в его текущей редакции) настроен так, что пользователи могут загружать изображения и создавать каталоги, но не могут изменять и удалять уже существующие. Уже загруженные изображения доступны всем readonly.
То есть один из вариантов решения в случае с Вашими требованиями - поставить Spaw, сделать его редактором по-умолчанию без права выбора другого редактора.
По JCE может еще подскажут...
P.S.: А почему Joostina 1.2.0
RC 5, когда уже давно доступен релиз?