Стандартными средствами - никак, только с помощью выполнения SQL-запроса. Допустим, если речь идет о 2-х статьях с идентификаторами 123 и 125, и мы все перенесли в статью с идентификатором 123, то выполняем вот такой запрос:
UPDATE jos_jcomments SET object_id = 123 WHERE object_id = 125 AND object_group='com_content';
Если у нас комментарии были к файловому архиву, а тепереь в видео галерею, то нужно нечто типа такого:
UPDATE jos_jcomments SET object_id = 145, object_group='com_seyret' WHERE object_id = 125 AND object_group='com_jdownloads';
Таким запросом мы перебрасываем комментарии с файлового архива JDownloads (id файла 125) на запись в видеогалерее Seyret (id записи 145).
Ну а выносить это в интерфейс, честно говоря особого смысла пока не вижу, тем более, что есть куча более важных задач, которые нужно решать.