JComments 2.1.0.0 не содержит кода для обновления с JComments 1.4, потому как таскать за собой списки изменения по всем версиям это очень накладно, и никому не нужно. Поэтому я рекомендую обновляться своевременно.
В текущей ситуации вам необходимо выполнить следующие действия:
1. Удалите компонент JComments 2.1.0.0
2. Установите JComments 2.0.0.20 (
com_jcomments_v2.0.0.zip)
3. Удалите JComments 2.0.0.20
4. Установите JComments 2.1.0.0
А в будущем, старайтесь своевременно обновлять JComments. Ведь каждая новая версия помио новых функций содержит весьма приличное количество исправлений ошибок (как действующих, так и потенциальных), и как правило существенно производительней предыдущих.