Яндекс. Индексация сайта установленного в поддиректорию. - Поисковая оптимизация, продвижение сайтов на Joomla (SEO)

Есть два сайта. Домен и субдомен
Домен установлен в поддиректорию по рекомендациям..
К сайтам применил "Улучшение Joomla для SEO (Хак для title)".
В Googl-е и Рамблере все прекрасно индексируется на обоих саитах. Но в яндексе индексируется только субдомен.
Домен уже месяца два как упорно не могу скормить яндексу.
Захожу по ссылке _http://webmaster.yandex.ru/  ввожу url - бот тут же заходит один раз на сайт и тишина. Жду пару недель - сайт не индексируется.
Кто сталкивался с подобной проблемой?

а в Яндекс писать не пробовали?

Добавил в конце файла robots.txt директиву:
Host: www.сайт.com  по рекомендациям.
Подожду немного. Если ничего не получится - напишу в Яндекс.

Два раза писал в Яндекс - уже давно. Первого ответа так и не дождался. Второй раз пришло обычное письмо с обещанием разобраться. Результат нулевой. Сайт так и не индексируется. Хоть бы причину подсказали!

это как повезет. У меня один сайт месяца 2-а болтался без индексации, а один в течение 3-х дней стал индексироваться. Где-то читала, что к августу теперь надо готовиться, будут и PR и яндекс обновляться. Вот жду.