Метки - ZOO

Влияют ли метки на SEO ?
Не будет ли из за них дубликатов?

Влияют. Главное это правильный подбор меток: уникальное содержимое и тайтлы.
Дублей не будет, ибо SEF и rel="canonical".

ибо SEF ? не понял?

вот ссылки на метках такие: site.ru/dostavka-pitstsy/tag/доставка%20пиццы.html
Перехожу по ней, открываю код и нет так ссылки canonnical

rel="canonical" — только для канонических страниц. На карточках продукции есть.
SEF и canonical решают проблему дубликатов страниц, когда одна и та же страница доступна по нескольким урлам.
А бывает ещё дублирование контента. Чем отличается /dostavka-pitstsy/ от /доставка%20пиццы.html? Думаю ничем, такие метки вредны.

понятно. метки должны по смыслу не совпадать с категориями)