Спасибо! Нашёл инструкцию:
Создаём файл
шаблон/html/mod_custom/default.php
<?php
defined('_JEXEC') or die;
if($moduleclass_sfx){
echo '<div class="'.$moduleclass_sfx.'">' . $module->content . '</div>';
}
else{
echo $module->content;
}
?>
И всё, проклятый custom не рендрится, когда его там нет, да и без этого класса код читабельнее.