не вопрос, все прекрасно работает и в отключенном виде, главное - не иметь привязок меню к отключенным компонентам
доступ к аяксу с фронта вы и так не получите - это компонент, доступный только для админки и с фронта вызывается только через фреймворк
материалы и метки и так отключены, ибо юзается зу, баннеры и умный поиск вообще на корню бы вырезал как зло, но потом при обнове глючит, приходится отключенными держать