3.8.13->3.9.0: файлы есть, а новых типов нет - Joomla 3.x: Установка, обновление и настройка

Обновил c 3.8.13 до 3.9.0 путем распаковки файла Joomla_3.9.0-Stable-Update_Package.zip в корне сайта. Такой  способ работал при обновлениях в рамках 3.8.x до 3.8.y. Как оказалось, он не работает при обновлении до 3.9.0. Все нужные новые папки появились (например, plugins/actionlog, plugins/privacy,...), а в базе данных нужных изменений не сделано. Например, для плагинов не появились новые типы actionlog и privacy.

Подскажите, как исправить ситуацию.

а зачем обновляться папкой?
надо было просто кнопкой

После такого обновления как минимум надо запустить Расширения- Менеджер расширений - База данных и пофиксить все ошибки.

1. Насчет БД :
Версия схемы базы данных (из #__schemas): 3.9.0-2018-10-21.
Версия обновления (из #__extensions): 3.9.0.
Драйвер БД: mysqli.
167 изменений базы данных были успешно проверены.
206 изменений базы данных не изменили структуру таблиц и были пропущены.

2. Я посмотрел через phpmyadmin:

все новые таблицы для 3.9.0 присутствуют (action_logs, Action_logs_extensions,...), но нет нужных строк в таблице extensions. Например, для com_actionlogs: com_actionlogs,component,com_actionlogs,,1,1,1,1,{"name":"com_actionlogs","type":"component","creationDate":"May 2018","author":"Joomla! Project","copyright":"Copyright (C) 2005 - 2018 Open Source Matters. All rights reserved.","authorEmail":"admin@joomla.org","authorUrl":"http://www.joomla.org","version":"3.9.0","description":"COM_ACTIONLOGS_XML_DESCRIPTION","group":""},.....

Как теперь сделать все нужные изменения в таблице extensions ?

Проблему решил следующим образом: из папки administrator/components/com_admin/sql/updates/mysql объединил все sql-файлы для версии 3.9.0 в один.
Затем в этом файле заменил #_ на префикс своей базы данных и через phpMyAdmin выполнил этот sql-файл. Все нужные изменения в БД выполнились и нужные объекты (меню, модули,...) добавились.

Вот интересно, зачем такие танцы с бубном, если для обновления достаточно нажать кнопку Обновить Joomla и все в течение двух минут обновиться. Я несколько своих сайтов так обновил и никаких проблем не было.

С этим никто не спорит.

На сайте много исправленного вручную кода, поэтому "автоматическое" обновление - это необходимость затем отслеживать, "сохранность" и "работоспособность" всех ранее внесенных исправлений.