Добрый день! Наткнулся на такую проблемку (Joomla 1.5.22, AUP 1.5.13, CB 1.4). Сделал как Вы сказали выше:
Проверял, оба варианта работают, при условии, что у вас стоит интеграция с CommunityBuilder
Первая ссылка обрабатывается через установки AUP и подбирает указанный в установках меню компонент для регистрации. Т.е. при смене интеграции будет переадесовывать на др.компонент регистрации.
Вторая - напрямую и только в CommunityBuilder.
К вышеописанной проблеме отношения не имеет. Конфликт может возникать при наличии нескольких компонентов для регистрации на сайте включенных - одновременно.
- удачи 
Т.е. отключил разрешение регистрации пользователей в Joomla (в админке в общих настройках), включил только в СВ независимо от глобальных настроек. При таком раскладе при открытии сайта по ссылке из пункта меню AUP "Пригласить" - http://сайт.com/component/user/?task=register&referrer=имя (ID) (
моя рефссылка) выдает 403 ошибку. При разрешенной глобальной регистрации в Joomla открывает страницу регистрации СВ.
При открытии ссылки из профиля СВ - http://сайт.com/component/comprofiler/registers?referrer=имя (ID) (
моя рефссылка) выдает "Вы не авторизованы для доступа к этой странице! Вам необходимо зарегистрироваться на сайте или войти." как при включенной, так и при выключенной регистрации Joomla. Где копать? Спасибо!