Блин... сам с собой общаюсь
))
Вобщем причина в чем-то другом...
Убрал проверку версии в vmshop_1c.php
if (VM_VERVM == '2')
{
define ( 'DBBASE', 'virtuemart' );
require_once(JPATH_BASE_1C .DS.'translit.php');
}
else
{
define ( 'DBBASE', 'vm' );
}
оставил только строки
define ( 'DBBASE', 'virtuemart' );
require_once(JPATH_BASE_1C .DS.'translit.php');
теперь вновь созданные таблицы создаются с правильным префиксом
2014-01-24 10:07:48 INFO 127.0.0.1 - Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 0: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_category_to_1c`)
2014-01-24 10:07:48 INFO 127.0.0.1 - Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 1: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_product_to_1c`)
2014-01-24 10:07:48 INFO 127.0.0.1 - Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 2: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_manufacturer_to_1c`)
Но дальше проблема все равно осталась 
2014-01-24 10:07:48 INFO 127.0.0.1 - Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 3: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_category`)
2014-01-24 10:07:48 INFO 127.0.0.1 - Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 4: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_category_xref`)
2014-01-24 10:07:48 INFO 127.0.0.1 - Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 5: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_manufacturer`)
DlMON а подробнее расскажи как решил проблему.
Этап 4) Импорт содержимого файлов
Этап 4.1.1) Проверка базы данных совместимости 1с и VMSHOP
Этап 4.1.1) База product_to_1c создана
Этап 4.1.1) База category_to_1c создана
Этап 4.1.1) База manufacturer_to_1c создана
Этап 4.1.1) XML import.xml загружен
Этап 4.1.1) Базы созданы, переходим к процесу отчистки
Этап 4.1.1) Версия схемы XML 2.05 VM_XML_VERS = 203
Этап 4.1.1) Начинаем отчистку таблиц
Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 0: (TRUNCATE TABLE `#__vm_category_to_1c`)
Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 1: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_to_1c`)
Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 2: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturer_to_1c`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 3: (TRUNCATE TABLE `#__vm_category`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 4: (TRUNCATE TABLE `#__vm_category_xref`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 5: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturer`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 6: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturer_category`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 7: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 8: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_category_xref`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 9: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_mf_xref`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 10: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_attribute`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 11: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_attribute_sku`)
Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 12: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_files`)
Этап 4.1.1) Закончили отчистку таблиц
Этап 4.1.2) Базы отчищены, переходим к процесу создания категорий
--------------------Склад № 2--------------------
Этап 4.1.2) Проверяем категорию Склад № 2
Этап 4.1.2) Неудача: Невозможно создать категорию - Склад № 2
как продвинулся дальше?
chekver
if ((($sh_version >= "200" and $sh_version <= "299") and $version != "2.0.0-RC-2M" and $version_status == "Final") or $sh_version == "2026d")
2.0.26d изменил на 2026d
новая ошибка
2014-02-24 07:Этап 4) Импорт содержимого файлов
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Проверка базы данных совместимости 1с и VMSHOP
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) База product_to_1c создана
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) База category_to_1c создана
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) База manufacturer_to_1c создана
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) XML import.xml загружен
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Базы созданы, переходим к процесу отчистки
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Версия схемы XML 2.05 VM_XML_VERS = 203
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Начинаем отчистку таблиц
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 0: (TRUNCATE TABLE `#__vm_category_to_1c`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 1: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_to_1c`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 2: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturer_to_1c`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 3: (TRUNCATE TABLE `#__vm_categories`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 4: (TRUNCATE TABLE `#__vm_category_categories`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 5: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturers`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 6: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturercategories`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 7: (TRUNCATE TABLE `#__vm_products`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 8: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_categories`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 9: (TRUNCATE TABLE `#__vm_product_manufacturers`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 10: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_medias`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 11: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_product_medias`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 12: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_category_medias`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 13: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_product_customfields`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Выполнен запрос № 14: (TRUNCATE TABLE `#__virtuemart_customs`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 15: (TRUNCATE TABLE `#__vm_categories_ru_ru`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 16: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturers_ru_ru`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 17: (TRUNCATE TABLE `#__vm_manufacturercategories_ru_ru`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Неудача: Ошибка запроса № 18: (TRUNCATE TABLE `#__vm_products_ru_ru`)
2014-02-24 07:Этап 4.1.1) Закончили отчистку таблиц
2014-02-24 07:Этап 4.1.2) Базы отчищены, переходим к процесу создания категорий
2014-02-24 07:--------------------Склад № 2--------------------
куда дальше капать