Решил проблему, изменив кодировку в браузере. Заметил еще некоторые ошибки, не знаю связано это с взаимодействием с браузером самого JCK или нет:
1. В Opera 11.52 - у меня на сайте названия материалов довольно большие, и наверно из-за этого когда я добавляю ссылку на какой либо материал тот раскрывающийся список, весь разъезжается( точнее смещается вниз)
2. В Firefox 6. - при добавлении ссылки на статью, в диалоговом окне, в котором нужно выбрать материал, список попросту не раскрывается.(только родительские Content и Menu)
3. В Explorer 9. - при редактировании статьи (статья которая была создана ранее, до того как я установил JCK) в которой были картинки, собственно эти картинки почему то не отображаются.
4. В Explorer 8. - Пока ошибок не увидел, работает как надо.
Вообще мне редактор понравился, для меня в нем удобно редактировать материал. Очень удобно сделана кнопка(и функционал) - "Исходный код". Но так как я побольшей части работаю в Opera(В Explorer совсем редко) пока вернулся на JCE.