Раз уж все основные косяки устранены, опишу что, как и куда. Огромное спасибо
era и
SmokerMan за оказанное содействие.

И так:
1) Ставим плагин
Modalizer от NoNumber и настраиваем его.
2) У многих шаблонов есть подшаблон (обычно он располагается в корневой папке шаблона и называется component.php) представляющий из себя легкую версию вашего основного шаблона.
Можете использовать его, либо создать отдельный файл и указать его в настройках Modalizer.
3) Для ссылки "Создать материал" все просто. Создаем пункт меню и для ссылки задаем класс modal
4) Теперь самое интересное. Иконка редактирования. Заходим в папку
/components/com_content/helpers и копируем файл
icon.php в папку
/имя_вашего_шаблона/html/com_content5) Открываем
icon.php и редактируем в нем три строчки:
a) ~20 строчка.
меняем на
б) ~105 строчка, чтобы ссылка подхватывала подшаблон после
index.php? добавляем
ml=1& чтобы было
$url = 'index.php?ml=1&option=com_content&task=article.edit&a_id='.$article->id.'&return='.base64_encode($uri);
в) ~126 строчка, делаем ссылку и задаем ей класс
$output = '<span class="hasTip" title="'.JText::_('COM_CONTENT_EDIT_ITEM').' :: '.$overlib.'"><a href="'.$url.'" class="modal">'.$text.'</a></span>';
6) Наконец подключаем это все (на примере /html/com_content/featured/default_item.php)
a) В начале подключаем наш
icon.php после
defined('_JEXEC') or die;
добавляем
require_once (JPATH_THEMES . DS . $app->getTemplate(). DS . 'html/com_content/icon.php');
б) Наконец находим
<?php echo JHtml::_('icon.edit', $this->item, $params); ?>
именяем
'icon.edit' на
'myicon.edit'Примечание. в пункте 6а можно использовать и
require_once (dirname(__FILE__).DS.'icon.php'); но тогда
icon.php придется пихать во все папки где его нужно подключить.
TODO. Нужно сделать чтобы после нажатия Сохранить или Отмена в форме редактирования материала модальное окно закрывалось. Так как сейчас после нажатия в модальном окне просто загружается сайт.
Читать решение тут