Как вывести Box на примере шаблона ? - Joomla 3.x: Шаблоны, разметка и макеты вывода

Это зависит от размещаемого контента. В демке он как раз одинаков, вам же свой контент в модулях отдельно для этого подгонять надо.

1. Там в одной строке несколько модулей в одной позиции.
2. Там каждый модуль содержит одинаковый контент.
Квадратики выравниваются равной ширины автоматом, зависит от кол-ва опубликованных в позиции модулей. Т.к. содержание модулей одинаково, высота их при равной ширине также будет одинакова. Это в демке сделано специально, для привлекательности и привлечения клиента (неплохо работает, правда?).
Если в разных модулях ваш контент разный, то и выглядеть он будет по разному, это нормально.

Во первых вам огромное спасибо.

Если я правильно понял, надо выставлять каждый квадратик - бокс, как отделбный модуль статьи из категории и подгонять, что бы текст был одинакового размера ?

Но как из этого бокса сделать ссылку на полный текст статьи ? Пытался разделителем, но всегда текст выводится как целая статья. Видно разделение, но не получается что бы в боксе выводилась только вступительная часть.

Да не за что =)
Да, вы поняли правильно.
А это зависит от используемых модулей. По моему, стандартный модуль вывода материала не разбивает текст на интро- и полную части, здесь нужен или его допил или свой модуль.