GIT, весь сайт или только свои дороботки - Флейм

Всем привет. Задался вопросом как правильно организовать работу с GIT, а точнее выгружать весь проект сайта, или только свои доработки под контроль версий?
Есть магазин на Joomla + jshopping, доработки: отдельно шаблон Joomla, отдельно шаблон jshopping, несколько модулей, десяток плагинов, несколько своих контроллеров/table/view для jshopping. На проект заказчик планирует периодически подключать фрилансеров для дописывания функционала не хакая движок и магазин. Вот что правильнее хранить в GIT под контролем, для обновления сначала на тестовый поддомен потом на продакшн?
Joomla и jshopping будут обновляться отдельно, сначала на локале, потом на тестовом, потом на проде, с оф.серверов, а доработки из GIT репо, или делать весь проект под GIT? Тогда на локале обновил joomla+jshopping+дороботки, все закоммитить в репо и из репо прод. обновить?  Вот как правильнее, не будет ли проблем с обновлением движка на прод.сервере?

в идеале под гитом должен быть весь код.

В IDE PhpStorm есть готовый gitignore, надо будет только для сторонних расширений добавить и тогда всё можно будет спокойно обновлять.

Если проект(весь сайт) не ваш. То только доработки. Причем дернули нужные файлы. Добавили в git сделали комит, типа Prepare XXX

Если проект(весь сайт) не ваш. То только доработки. Причем дернули нужные файлы. Добавили в git сделали комит, типа Prepare XXX

Да, спасибо, вот тоже так подумал правильнее будет. Движок и компонент магазина из оф.серверов обновлять буду, а только свои контроллеры и плагины на bitbucket закину. Остальное в .hgignore.