Настройка чпу после индексации сайта стоит настраивать или оставить? - SEF (ЧПУ)

Попросили настроить чпу, а сайт уже проиндексирован 874 страницы (магазин)
стоит настраивать или оставить как есть?
включаю в админке чпу ссылки отображаются следующим образом www.сайт.ru/index.php/index.php/ ну это ладно разберусь, интересу вопрос настраивать вообще стоит.

Стоит, но перед этим проверьте, что при вводе не чпу-ссылки переадресовывает на чпу и ответ сервера 301.

вопрос схожий, потому не стал плодить темы:
Есть новостной сайт с тысячами страниц. алиасы мы начали прописывать при создании материала только полгода назад примерно. Т.е. на сайте материалы со ссылками как без алиасов:
/index.php?option=com_content&view=article&id=60:kirill&catid=3:2009-05-29-09-45-05&Itemid=13
так и с ними
/index.php?option=com_content&view=article&id=3036:kakaya-to-fraza-so-smislom&catid=9:2009-06-07-14-42-53&Itemid=21
Рубрики тоже стоят пока без алиасов.

Как поступить, чтобы не просесть в выдаче из-за ненайденных страниц и/или дубликатов?

1. Дать алиасы рубрикам
2. Забить на старые материалы (пусть так и остаются с джумловскими ссылками) и в Общих настройках включить Установки Search Engine Optimization
3. Как тогда сделать редирект в хтаксессе?

или

1. Дать алиасы рубрикам
2. Каким-нибудь из плагинов (видел, что sh404SEF и ukr_rus_что-то там такое делают) автоматом переписать в алиасы заголовки материалов
3. Прописать правило в хтаксессе
4. Что-то еще?

Какой-то другой порядок действий?
Я просмотрел все 22 страницы тем по SEO на этом форуме.

Никаких плагинов.
Просто прописать алиасы и включить SEF.

По идее стандартный SEF должен редиректить старые адреса на новые - но лучше проверить что это так.

т.е.
1. даю алиасы рубрикам (всем статьям - просто рук не хватит)
2. Включаю SEF

а падение в поисковиках будет? Можно ли как-то избежать, если да.
_{извиняюсь за дилетантскую подачу вопроса, над проблемой мучаюсь уже пару недель, все никак не могу решиться. Ищу 100%-но верный вариант.
Жаль будет просесть, сайту уже 6 лет, а тут конкуренты повылазили. Мало того, что воруют материалы, так еще по запросам порой выше или рядом. Как одну из мер решили включить SEF.}