Появилась проблема в метрике после установки sh404SEF - SEF (ЧПУ)

Добрый день! После установки sh404SEF, все супер На основные разделы сайта ссылки - сanonical Мета данные удобно добавлять и т.д.
Кроме одного приходит раз или два раза в сутки о проблеме с доступностью сайта в Яндекс метрике. И вебмастер не обновляет главную страницу.  Сайт провалился в поиске. Вот ссылка на сайт https://www.bizness-foto.ru
Сайт для пользователей доступен, по логам сервера все нормально, иногда именно боту 404 главной, а потом все ок.
Бота Яндекс иногда не пускает. Почему - хз. с Google все нормально.
В настройках задействовано была функция безопасности, анти-флуд и т.д. отключил. Не помогло. Кэш чистил полностью.
Может есть кэш в самом компоненте? я не нашел.
Если было у кого нибудь, подскажите в чем может быть проблема !

P.S. Я уже все по отключал в шаблоне: компрессию CSS, js ни хрена не пойму.

Нагрузка на мускул. Включите лог медленных запросов  мускул.

Нагрузка на мускул. Включите лог медленных запросов  мускул.

Спасибо! Написал хостеру, он ответил:
Подключили логирование долгих запросов к базе, которое завершится через 4 часа.
На что смотреть?
или сюда закинуть log?

На тайминг, запрос, количество строк. В логе медленных запросов структура однотипная .
В .htaccess левым ботам закрыт доступ ?

На тайминг, запрос, количество строк. В логе медленных запросов структура однотипная .
В .htaccess левым ботам закрыт доступ ?

нет.
.htaccess стандартный, только 301 на www и все. 

FAQ - редиректы в htaccess
п.10 и мой список https://joomla-support.ru/thread/46544/

FAQ - редиректы в htaccess
п.10 и мой список https://joomla-support.ru/thread/46544/

Спасибо!