Как изменить вид меню на сайте? - Joomla 3.x: Общие вопросы

Но в какой строке именно это меняется - непонятно..

не могу найти, где это меняется..

Так и не нужно искать. Последнее правило переопределяет предыдущее. И в такой способ старые правила остаются, чтоб откатить как было.
Добавляете в конец файла стилей свое новое правило.

Код

.nav-pills > li > a {
  background: blue;
}
.nav-pills > li > a span {
  color: white;
font-weight:bold;
}